1991. gada 19.septembrī tika izveidota Speciālo uzdevumu vienība.

Speciālo uzdevumu vienības pakļautības maiņas un reorganizācijas:

1991. gads – Augstākās Padomes Apsardzes dienestā kā Speciālo uzdevumu bataljons.

1992. gads – Latvijas Republikas Drošības dienesta Speciālo uzdevumu vienība (SUV).

1994. gads - Latvijas Republikas Drošības dienesta reorganizācija un pakļautības maiņa (Latvijas Republikas Jūras spēku Speciālo uzdevumu vienība).

1999. gads – vienības pakļautības maiņa. SUV tieši pakļauta Nacionālo Bruņoto Spēku komandierim kā atsevišķa vienība (NBS SUV).

2003. gads – štatu un pakļautības maiņa. Apakšvienības sastāvā tiek iekļauta Zemessardzes Speciālo uzdevumu vienība „Vanags”. Administratīvā pakļautība tiek noteikta Sauszemes spēku komandierim, operatīvā pakļautība NBS komandierim.  

2006. gads – pakļautības maiņa. 

Speciālo uzdevumu vienības komandieri:

• SUV komandieris no 1991. gada līdz 1997. gadam – komandkapteinis Jānis Kušķis.
• SUV komandieris no 1998. gada līdz 2001. gadam – komandkapteinis Harijs Arnicāns.
• SUV komandieris no 2001. gada līdz 2003. gadam – komandkapteinis Valerijs Lācis.
• SUV komandieris no 2003. gada līdz 2004. gadam – majors Armands Fridrihsons.
• SUV komandieris no 2005. gada līdz 2006. gadam – majors Andris Bukovskis.
• SUV komandieris no 2006. gada līdz 2010. gadam – komandkapteinis Rudolfs Rudzuroga.